Vybrané masivně paralelní sekvenační služby pro projekty

Předmět plnění:
- vybrané masivně paralelní sekvenační služby pro projekty
- různé typy sekvenačních služeb na bázi čtení pořadí nukleotidů v řetězcích DNA molekul (a to jak DNA-Seq, tak RNA-Seq), jakož i další doplňkové služby související s přípravou a kontrolou vzorků k těmto analýzám a s analýzou získaných dat
- zakázka rozdělena na 9 částí:
- 1. Párové sekvenování jedné knihovny/poolu 2×150 bp v kvantitě min. 1,5 Gb a průměrné kvalitě identifikace nukleobazí na každý jednotlivý read (sekvenci) minimálně 30 nebo vyšší pro alespoň 70 % readů
- 2. Párové sekvenování knihovny/poolu 2×150 bp v kvantitě min. 50 Gb a průměrné kvalitě identifikace nukleobazí na každý jednotlivý read (sekvenci) minimálně 30 nebo vyšší pro alespoň 70 % readů
- 3. Párové sekvenování knihovny/poolu 2×150 bp v kvantitě min. 240 Gb a průměrné kvalitě identifikace nukleobazí na každý jednotlivý read (sekvenci) minimálně 30 nebo vyšší pro alespoň 70 % readů
- 4. Párové sekvenování knihovny/poolu 2×150 bp v kvantitě min. 765 Gb a průměrné kvalitě identifikace nukleobazí na každý jednotlivý read (sekvenci) minimálně 30 nebo vyšší pro alespoň 70 % readů
- 5. Párové sekvenování knihovny/poolu 2×250 bp v kvantitě min. 5 Gb a průměrné kvalitě identifikace nukleobazí na každý jednotlivý read (sekvenci) minimálně 30 nebo vyšší pro alespoň 60 % readů
- 6. Párové sekvenování knihovny/poolu 2×250 bp v kvantitě min. 12.5 Gb a průměrné kvalitě identifikace nukleobazí na každý jednotlivý read (sekvenci) minimálně 30 nebo vyšší pro alespoň 60 % readů
- 7. Párové sekvenování knihovny/poolu 2×300 bp v kvantitě min. 6 Gb a průměrné kvalitě identifikace nukleobazí na každý jednotlivý read (sekvenci) minimálně 30 nebo vyšší pro alespoň 55 % readů
- 8. Párové sekvenování knihovny/poolu 2×300 bp v kvantitě min. 15 Gb a průměrné kvalitě identifikace nukleobazí na každý jednotlivý read (sekvenci) minimálně 30 nebo vyšší pro alespoň 55 % readů
- 9. Sekvenování dlouhých readů o délce minimálně 1500 bp v kvantitě min. 4 Gb a průměrné kvalitě identifikace nukleobazí na každý jednotlivý read (sekvenci) minimálně 25 nebo vyšší pro 70 % readů
- podrobná specifikace je v příloze

Hodnoticí kritéria:
- nejnižší nabídková cena

Lokalita:
- Praha a okres Praha-západ, Jindřichův Hradec, Náchod

Termín:
- na 24 měsíců

Přílohy: